Documentación del "Taller sobre informatización de colecciones botánicas" Valencia, Septiembre 2003

 

Programa del Taller

 

Presentaciones Powerpoint:

 

Software para informatizar colecciones:

 

Asistentes del taller:

 

Links presentados en el taller, con breve descripción:

Spanish and Portuguese Platform for Botanical Diversity Data Online - Proyecto presentado y aprobado por AHIM (Asociación de Herbarios Ibero- Macarónesico; http://www.ahim.org), y financiado por GBIF:
 http://www.gbif.org/Stories/STORY1063920331/#Title:_Spanish_and_Portuguese_Platform 

Sitio web de GBIF (Global Biodiversity Information Facility/Infraestructura Mundial sobre  Información en Biodiversidad) http://www.gbif.net, lista de Miembros: http://www.gbif.org/GBIF_org/participation

European Network of Biodiversity Information http://www.enbi.info ENBI es la contribución europea a GBIF. El objetivo de ENBI es establecer y mantener una red europea que conecta relevantes instituciones y proyectos relevantes para la biodiversidad europea. Comisión Europea

Biological Collection Access Service for Europe http://www.biocase.org El proyecto BIOCASE ofrece a los investigadores un servicio de información on-line de las colecciones biológicas de Europa. Comisión Europea

Ejemplos de interoperabilidad:

Herbario de Criptogamia (Madrid) http://161.111.170.202/herb/asp/ Real Jardín Botánico, CSIC. 

Acceso unificado, información distribuida – REMIB, Méjico:  http://www.conabio.gob.mx/remib/doctos/remibnodosdb.html Desde esta sección se puede acceder a cualquiera de los nodos de la REMIB marcando el recuadro de la base de datos deseada. Las bases de datos se encuentran en constante actualización.

OBIS Dynamic Specimen Mapper (EE.UU.)   http://hercules.kgs.ukans.edu/website/Specimen_Mapper/mapit.cfm?xmlsource=http://161.111.170.202/herb/xdata/echinos.xml
Kansas Geological Survey and the HEXACORALLIA Project

Condiciones de uso de los datos:

http://www.rjb.csic.es/herbario/crypto/crypcond.htm Herbario de Criptogamia, Madrid

http://www.conabio.gob.mx/remib/cgi-bin/clave_remib.cgi?lengua=es-MX REMIB, Méjico

http://tsadev.speciesanalyst.net/documentation/ow.asp?DataUseConstraints The Species Analyst Network. Univ. of Kansas Natural History Museum and Biodiversity Research Center

Ejemplos de aplicaciones:

Lifemapper http://www.lifemapper.org Utiliza registros de colecciones de museos y herbarios para generar el perfil ecológico de cada especie, muestra donde la especie ha sido encontrada y dónde puede livir potencialmente. Puede utilizarse para identificar áreas de alta prioridad para la conservación y para estudiar diferentes escenarios como la expansión de especies invasoras o plagas, cambios climaticos etc. Sirve también como salva-pantallas. Univ.Kansas, EE.UU.

DesktopGarp http://www.lifemapper.org/desktopgarp/ es un paquete de software destinado a la investigación en ecología y biodiversidad que permite analizar y predecir la distribución potencial de especies silvestres a partir de datos ambientales y biológicos. GARP es un acronimio de Genetic Algorithm for Rule Set Production Univ.Kansas, EE.UU. David Stockwell

La aplicación WhyWhere http://biodi.sdsc.edu/ww_home.html combina una imensa base de datos ambientales, datos de teledetección, potentes algoritmos de procesado de imágenes y cluster computing en un sistema único de búsqueda y online-mapping que da respuesta a la pregunta “Dónde está y porqué” de cualquier especie, en cualquier lugar del mundo. Univ.California, San Diego, EE.UU.

Presentación powerpoint "Challenges in Biodiversity Informatics"  http://biodi.sdsc.edu/Presentation1.zip - explica principios y ejemplos del análisis GARP,  WhyWhere entre otros. San Diego, EE.UU. David R.B. Stockwell http://biodi.sdsc.edu/doc.html

Proyectos informáticos de "código abierto":

La pagina web más grande del mundo destinada para el desarrollador de software de código abierto (Open Source) http://sourceforge.net